Le Protocole donne des orientations aux organisations compétentes du système des Nations Unies sur la fourniture de l’assistance et du soutien aux victimes d’exploitation et d'abus sexuels, perpétrés par le personnel des Nations Unies et apparenté ou par des forces non-onusiennes opérant sous mandat du Conseil de sécurité des Nations Unies. Il vise à assurer la cohérence de l'assistance fournie aux victimes d'exploitation et d'abus sexuels dans toutes les entités des Nations Unies, qui ont l'obligation d’assurer un suivi de toutes les victimes grâce à une base de données. Depuis mars 2017, le Protocole est testé sur le terrain dans quatre pays par des missions et des équipes de pays des Nations Unies en République centrafricaine, en République démocratique du Congo, en Iraq et au Mali.